ספר רסיסי לילה פרק מד - וידוע מה שכתוב בזוהר (ח"ג רטז ריש ע"ב) דהיה ראוי להיות מתן תורה בדור המבול והיה אז גם כן משה רבינו ע"ה בשגם בגימטריא משה אלמלי זכו רק שבחטאם נתהפך שפע מי התורה למי המבול. וכן אמרו בזבחים (קטז.) דבשעת מתן תורה נתקבצו אומות העולם לבלעם ... שמא הקב"ה מביא מבול שכפי ענינם היו חושבים שפע מי תורה הבא לעולם למי מבול.
Why is the destruction of the world specifically through water?
The Sfas Emes (5656) says the sin of the dor of the Mabul was that they lost their צלם אלקים. Naturally man has a צלם אלקים which places him above the animals and that is why after the mabul it says וּמוֹרַאֲכֶ֤ם וְחִתְּכֶם֙ יִֽהְיֶ֔ה עַ֚ל כׇּל־חַיַּ֣ת הָאָ֔רֶץ וְעַ֖ל כׇּל־ע֣וֹף הַשָּׁמָ֑יִם בְּכֹל֩ אֲשֶׁ֨ר תִּרְמֹ֧שׂ הָֽאֲדָמָ֛ה וּֽבְכׇל־דְּגֵ֥י הַיָּ֖ם בְּיֶדְכֶ֥ם נִתָּֽנוּ for naturally animals fear this in man. However, this was lost before the flood since man has sinned so greatly they destroyed their צלם. He explains that the mabul generation sinned due to their desires, their תואה and it was in this way that they lost their צלם. The צלם of a person is the ruchni part which allows one to rule over their gashmi base desires. When the gashmi takes control the צלם becomes eroded.
Water, as the Maharal says (Gevuros Ch. 18,) is חומר בלי צורה. It has no shape of its own, no spiritual backbone, it takes the shape of whatever container it is placed in. The punishment for the world for losing their spiritual backbone is to be destroyed by water which matches that way of living.
The Gemarah Zevachim cited by Rav Tzadok says that Bilam responded to the fears of the nations that Hashem was bringing another mabul, חמדה טובה יש לו בבית גנזיו שהיתה גנוזה אצלו תתקע"ד דורות קודם שנברא העולם וביקש ליתנה לבניו שנאמר (תהלים כט, יא) ה' עוז לעמו יתן [מיד] פתחו כולם ואמרו (תהלים כט, יא) ה' יברך את עמו בשלום. Why did they say ה' יברך את עמו בשלום? Rav Kook (Shmuot Ria"h) says that it was understood that it is due to the Torah that there is no need to destroy the world. It is was due to the overwhelming powers of gashmi which contaminated the world and cause the need for the purification waters of the mabul. However, due to the Torah coming to the world there is no need for destruction for the Torah has the ability to cause shalom, harmony between the gashmi and ruchni. The giving of the Torah is the antidote to the chumri. It is the Torah tavlin to fight against the yetzer.
The people of the dor hamabul had tremendous desires which led to their ultimate destruction. These desires were not because they were innately bad people but because they had big capabilities. Rav Tzaddok writes (Tzidkas Hatzaddik #44) מי שיש לו תשוקה גדולה לתאות הגוף, אל יתעצב בזה לחשוב כמה פגום הוא שיש לו תשוקה כל כך, כי אדרבא, הוא כלי מוכן לתוקף אהבת ותשוקת דרישת האמת. וכמו שנחמו ההוא סבא [אשר הוא אליהו לדעת יש מפרשים בתוספות פ"ק דחולין (דף ו.). ושמעתי דכן הוא האמת ודקו' תוספות שם אכ"מ] לאביי (בסוכה נב.). וע"ז אמרו (שם) דלעתיד לבוא צדיקים נדמה להם יצר־הרע כהר, ורשעים כחוט השערה – ואינו שקר, רק שניהם אמת, כי לאלו תשוקתם ותאותם עצומה ביותר. On who has strong desires for bodily pleasures it's also because one has the capabilities to have strong desires for ruchni. The generation of the mabul misused their desires but those desires may have been better suited for use in Torah study. That is why instead of the flood they may have been fixed by receiving the Torah. Sinai is also called הר חורב, one either receives the Torah or it leads to destruction.
The Zohar Toldos (138a) says אצטריך יצר הרע לעולם כמטרא לעולם דאלמלא יצר הרע חדוותא דשמעתא לא ליהוי. It is the drive of desire which also allows one to have a desire for chiddush in Torah. The Zohar compares it to rain which muddies the streets but is necessary to make crops grow. The comparison the Zohar draws it to water!
The Midrash says אתה מוצא אע"פ כן ארבעים יום בכל שנה היו עושין אותן המים רושם בעולם, עד שעמד שלמה, ובנה את בית המקדש, ופסקו אותן מ' יום, שנא' (ובשנת אחת) [ובשנה האחת] עשרה בירח בול (מ"א ו לח), מהו בירח בול, בירח שבלים לבהמה מן הבית. Even though the flood stopped, the message of the rain was still ever-present as the rain came down every year. The Shla says וכשנתנה תורה שעמד משה ארבעים יום בהר נתבטלו אלה, על כן נקרא ירח בול, נשאר מן מבול בהסתלק מ. It is the days of acceptance of the Torah which stopped the yearly flooding. It is the acceptance of the Torah that replaces the need for a mabul.